Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LtbrP50284 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbrP50284 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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