Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms