Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SrprbP47758 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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