Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kdm5cP41230 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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