Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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