Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pabpc1P29341 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms