Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PtprmP28828 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprmP28828 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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