Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxrgP28705 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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