Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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BrafP28028 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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BrafP28028 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
BrafP28028 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms