Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rpl3P27659 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms