Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd8P23463 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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