Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prim1P20664 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.9 ms