Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Fcer1aP20489 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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