Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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