Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms