Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm6880A3KG45 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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