Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc183A2AJB1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc183A2AJB1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms