Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms