Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc1Q9QZF2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc1Q9QZF2 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms