Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Chrac1Q9JKP8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms