Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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