Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tmem267-204ENSMUST00000178948 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Dlx1as-203ENSMUST00000140271 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm28657-201ENSMUST00000186950 687 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms