Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc52a2Q9D8F3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc52a2Q9D8F3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc52a2Q9D8F3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc52a2Q9D8F3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc52a2Q9D8F3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms