Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Ptp4a3Q9D658 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ptp4a3Q9D658 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms