Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spns3Q9D232 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms