Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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