Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Smim3Q99PE5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms