Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tsnaxip1Q99P25 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms