Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed9Q99KF1 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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