Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Stx18Q8VDS8 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Stx18Q8VDS8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms