Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms