Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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