Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms