Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc29Q80VM3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms