Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms