Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms