Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Ccdc18Q640L5 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms