Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm5aQ3UXZ9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms