Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Q3U6N9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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