Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kdm4dQ3U2K5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms