Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb38Q3LR78 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms