Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms