Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms