Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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