Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms