Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sh3bp2Q06649 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms