Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NfiaQ02780 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NfiaQ02780 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.3 ms