Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Apoa1Q00623 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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