Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SmsP97355 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SmsP97355 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SmsP97355 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SmsP97355 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SmsP97355 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SmsP97355 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SmsP97355 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SmsP97355 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SmsP97355 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SmsP97355 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms