Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cbx1P83917 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms